O Cepema, com origem numa parceria entre USP e Petrobras e derivado de uma compensação ambiental determinada pelo Ministério Público local, tinha como principal ambição ser um canalizador das pesquisas sobre meio ambiente desenvolvidas dentro da Universidade, possibilitando uma abordagem multidisciplinar única.
Os resultados que traduzem esse sucesso são a concretização de parcerias com entidades locais, a consolidação do Cepema como um centro de pesquisas de diversas unidades da USP e sua efetivação como um colaborador para a preservação do meio ambiente. O Cepema foi concebido para ser, de fato, um centro multidisciplinar na área ambiental.